Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3404Q9D506 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm3404Q9D506 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3404Q9D506 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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