Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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PrameQ9D4Z5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrameQ9D4Z5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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