Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcc1Q9D4H2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms