Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms