Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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