Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fndc8Q9D2H8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fndc8Q9D2H8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms