Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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