Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H0

Rita1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rita1Q9D1H0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rita1Q9D1H0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rita1Q9D1H0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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