Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Snu13Q9D0T1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms