Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms