Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc47Q9D024 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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