Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Shisa9Q9CZN4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms