Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms