Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms