Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pgpep1lQ9CWB5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms