Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9CRC3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9CRC3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms