Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ifitm3Q9CQW9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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