Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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