Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Nicn1Q9CQM0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Nicn1Q9CQM0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Nicn1Q9CQM0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Nicn1Q9CQM0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Nicn1Q9CQM0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Nicn1Q9CQM0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Nicn1Q9CQM0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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