Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Q9CQC3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Q9CQC3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Q9CQC3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Q9CQC3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Q9CQC3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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