Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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