Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prpf8Q99PV0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms