Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim3Q99PE5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms