Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup155Q99P88 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms