Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Atoh8Q99NA2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Atoh8Q99NA2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Atoh8Q99NA2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Atoh8Q99NA2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Atoh8Q99NA2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atoh8Q99NA2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms