Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a6cQ99N08 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms