Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms