Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms