Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
EpcamQ99JW5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms