Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ddb2Q99J79 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ddb2Q99J79 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ddb2Q99J79 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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