Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apobec3Q99J72 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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