Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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