Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfdQ925I7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms