Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trps1Q925H1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms