Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim59Q922Y2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim59Q922Y2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms