Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms