Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms