Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Sft2d2Q8VD57 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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