Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms