Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnaaf4Q8R368 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms