Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Nup58Q8R332 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Nup58Q8R332 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nup58Q8R332 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nup58Q8R332 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nup58Q8R332 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nup58Q8R332 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nup58Q8R332 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup58Q8R332 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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