Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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