Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms