Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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