Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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