Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Cldn34c1Q8K193 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c1Q8K193 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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