Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FgbQ8K0E8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FgbQ8K0E8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FgbQ8K0E8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FgbQ8K0E8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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