Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Znf628Q8CJ78 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms