Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ercc8Q8CFD5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms