Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms